2'-O-Methyl-rA(N-Bz)fosforamidit

2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Fosforamidit ialah monomer fosforamidit diubah suai yang boleh digunakan untuk sintesis oligonukleotida. Pengubahsuaian 2'-O-metil memberikan rintangan nuklease yang besar kepada oligonukleotida sambil mengekalkan sifat ikatan hidrogen dupleks RNA/RNA dengan lebih setia daripada hibrid DNA/RNA. Dalam aplikasi gangguan RNA (RNAi), 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite sering digabungkan ke dalam helai deria dan antisense dupleks RNA (siRNA) mengganggu kecil untuk meningkatkan kestabilan serum dan mengurangkan kesan luar sasaran tanpa menjejaskan aktiviti RNAi. 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite juga berfungsi sebagai blok binaan kritikal dalam sintesis kimia oligonukleotida RNA yang mengandungi pengubahsuaian 2'-O-methyladenosine khusus tapak; kumpulan pelindung (DMT pada 5', Bz pada N6, fosforamidit CE pada 3') membenarkan pemasangan bertahap helai RNA dengan kesetiaan tinggi dan kawalan pada pensintesis DNA/RNA automatik. Di luar terapeutik RNA, 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidete telah menemui aplikasi dalam sintesis model RNA bercabang fosfat untuk mengkaji seni bina RNA yang luar biasa dan dalam penyediaan probe oligonukleotida pendarfluor yang distabilkan secara terma.

Parameter Produk

Kenapa Cosperpharm? – Kelebihan Persaingan Kami

Kelebihan Produk

1. Pengubahsuaian 2′-O-Metil untuk Rintangan Nuklease dan Kestabilan Terma

Pengubahsuaian 2'-O-metil pada kedudukan ribosa 2' adalah salah satu pengubahsuaian kimia yang paling banyak disahkan dalam terapeutik oligonukleotida. Oligonukleotida yang menggabungkan 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Fosforamidit mempamerkan ketahanan yang ketara terhadap endo- dan exonucleases berbanding RNA yang tidak diubah suai, dengan peningkatan kestabilan haba dupleks RNA/RNA (peningkatan Tm) tanpa menjejaskan kekhususan pasangan asas Watson-Crick. Pengubahsuaian ini telah berjaya digunakan dalam ubat oligonukleotida yang diluluskan oleh FDA dan banyak calon peringkat klinikal.

2. Perlindungan N6-Benzoyl untuk Sintesis Kesetiaan Tinggi

Kumpulan pelindung benzoil (Bz) pada amina eksosiklik N6 asas adenin menghalang tindak balas sampingan yang tidak diingini semasa kitaran gandingan fosforamidit, seperti peristiwa bercabang atau penamatan rantai yang disebabkan oleh depurination atau asilasi. Kumpulan Bz dialih keluar dengan bersih di bawah keadaan penyahlindungan oligonukleotida standard (ammonia pekat, 55°C, 8–16 jam, atau AMA), menghasilkan asas adenine asli tanpa hasil sampingan yang boleh dikesan.

3. Pra-organisasi Konformasi Gula C3′-Endo

Penggantian 2'-O-metil mengunci gula ribosa ke dalam konformasi C3'-endo (Utara) — konformasi yang sama yang diterima pakai oleh RNA dalam dupleks bentuk A. Pra-organisasi konformasi ini mengurangkan penalti entropik apabila hibridisasi kepada sasaran RNA pelengkap, menghasilkan pertalian pengikatan yang lebih tinggi (Tm yang lebih tinggi) untuk oligonukleotida yang diubah suai 2'-O‑metil-metil berbanding DNA atau RNA yang tidak diubah suai daripada jujukan yang sama.

4. Keserasian Kumpulan Melindungi Standard untuk Sintesis Automatik

Fosforamidit 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) membawa kumpulan pelindung 5'-O-DMT dan N6-Bz yang sama yang digunakan dalam fosforamidit RNA standard, bersama-sama dengan fosforamidit β-cyanoethyl (CE) pada kedudukan 3'. Reka bentuk ini memastikan penyepaduan yang lancar ke dalam aliran kerja pensintesis DNA/RNA automatik sedia ada tanpa memerlukan protokol penyahlindungan khusus atau keadaan gandingan yang diubah suai.

5. Utiliti Terapeutik Luas Merentasi Platform Oligonukleotida

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidete digunakan merentas berbilang platform terapeutik oligonukleotida: siRNA (pengubahsuaian untai deria dan antisense), oligonukleotida antisense (ASO) untuk pembungkaman gen, aptamer untuk penghantaran disasarkan dan aplikasi diagnostik, dan probe diagnostik RNA yang diubah suai. Pengubahsuaian 2'-O-metil juga digunakan secara meluas dalam RNA panduan CRISPR‑Cas untuk meningkatkan kestabilan dan kecekapan penyuntingan.

Senario Aplikasi

1. Perkembangan Terapeutik siRNA

2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite digunakan untuk memperkenalkan pengubahsuaian 2'-O-methyladenosine ke dalam deria dan/atau helai antisense dupleks RNA (siRNA) yang mengganggu kecil untuk meningkatkan kestabilan serum, mengurangkan kesan luar sasaran yang dimediasi oleh jentera RNAi dan stimulasi LR7 (mis. pengaktifan). Pengubahsuaian 2'-O-metil ialah komponen standard bagi banyak platform siRNA maju secara klinikal.

2. Pengilangan Antisense Oligonucleotide (ASO).

2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Fosforamidite digabungkan secara meluas ke dalam oligonukleotida antisense untuk aplikasi pembungkaman gen. Pengubahsuaian 2'-O-metil memberikan rintangan nuklease kepada ASO dalam cecair biologi dan meningkatkan pertalian mengikat kepada sasaran RNA pelengkap tanpa mengganggu mekanisme belahan pengantara RNase H (apabila diletakkan dalam reka bentuk gapmer 2'-O‑metil/2'-deoksi).

3. Sintesis Kimia Oligonukleotida RNA

2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite berfungsi sebagai blok binaan untuk sintesis kimia fasa pepejal oligonukleotida RNA yang mengandungi residu 2'-O-methyladenosine khusus tapak. Kumpulan pelindung (5′-O‑DMT, N6‑Bz, CE fosforamidit) serasi dengan kitaran sintesis RNA standard dan keadaan penyahlindungan (NH₃, 55°C, 8–16 h, atau AMA), membenarkan penyepaduan yang lancar ke dalam aliran kerja sintesis yang telah ditetapkan.

4. Reka Bentuk Probe Oligonukleotida Pendarfluor

Pengubahsuaian 2'-O-metil meningkatkan kestabilan terma probe pendarfluor (cth., suar molekul, probe TaqMan) yang digunakan dalam PCR masa nyata dan hibridisasi in situ. 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite membolehkan pengenalan penstabilan pengubahsuaian ke dalam jujukan probe, meningkatkan nisbah isyarat-ke-bunyi dan membolehkan pengesanan lebih mantap bagi sasaran RNA kelimpahan rendah.

5. Pembangunan Aptamer menggabungkan aptamer yang diubah suai secara kimia

Nukleotida 2'-O-metil mempamerkan rintangan nuklease yang lebih baik, memanjangkan separuh hayat vivo, dan mempertingkatkan pertalian mengikat sasaran berbanding dengan aptamer RNA yang tidak diubah suai. 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite ialah blok binaan utama untuk menjana perpustakaan aptamer yang diubah suai 2'-O-metil melalui sintesis fasa pepejal.

6. Pengubahsuaian RNA (gRNA) Panduan CRISPR‑Cas

Pengubahsuaian 2'-O-metil yang diletakkan pada kedudukan tertentu dalam gRNA CRISPR‑Cas boleh meningkatkan kestabilan, mengurangkan imunogenisiti dan meningkatkan kecekapan penyuntingan dalam sel dan in vivo. 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite membolehkan pengenalan tapak khusus bagi sisa 2'-O-methyladenosine ke dalam gRNA yang disintesis secara kimia.

7. Penyelidikan RNA Bercabang Fosfat

Penyelidik yang mengkaji seni bina RNA yang luar biasa, seperti RNA bercabang fosfat, menggunakan 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramidite untuk menyediakan model oligonukleotida yang mengandungi satu kumpulan 2'-OH percuma untuk menyiasat kestabilan hidrolitik bagi hubungan phosphoriester bercabang di bawah keadaan fisiologi.

8. Kajian Kestabilan Terma Oligonukleotida Ubahsuai

2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite digunakan dalam kajian sistematik tentang kestabilan terma (Tm) dupleks oligonukleotida yang diubah suai, termasuk pencirian kesan kedudukan pengubahsuaian 2'-O-metil pada suhu lebur dupleks dan termodinamik hibridisasi.

9. Sintesis Oligonukleotida Fasa Pepejal

Pembangunan Proses Ahli kimia proses dan pakar sintesis oligonukleotida menggunakan 2'-O-Methyl-rA(N-Bz) Phosphoramite untuk mengoptimumkan keadaan gandingan, protokol penyahlindungan dan kaedah penulenan untuk pembuatan berskala besar terapeutik asid nukleik 2'-O-metil-diubah suai. Cosperpharm menyediakan data analisis khusus kelompok untuk menyokong aktiviti pengesahan dan peningkatan proses.

10. Pembangunan Kaedah Analisis untuk Kawalan Kualiti Oligonukleotida

2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Fosforamide digunakan sebagai piawai rujukan dalam pembangunan kaedah HPLC dan LC‑MS untuk mengkuantifikasi kandungan nukleosida yang diubah suai dalam bahan ubat oligonukleotida dan produk ubat, serta untuk mengenal pasti kekotoran berkaitan sintesis (cth., produk penyingkiran semula oksidan, D phosphite tidak lengkap).

Hubungi Kami

Perlu dipercayai, ketulenan tinggi 2′-O-Methyl-rA(N-Bz) Fosforamide untuk projek sintesis oligonukleotida anda yang seterusnya? Pasukan Cosperpharm bersedia membantu dengan spesifikasi produk, keperluan dokumentasi dan penyelesaian rantaian bekalan yang disesuaikan dengan aplikasi anda.